生物滤床流动池是生物膜滤池和填料流动池的组合。它的上部为流动部，其构造类似填料流动池，里面填装有颗粒状的生物滤床流动池并进行曝气。它的下部为生物膜过滤部，其构造类似生物膜滤池，里面填装有填料来过滤悬浮物。生物膜过滤部的氧气是通过在流动部曝气后的水里的溶解氧气的扩散得到供给的，而不是靠散气管来供给的，这点和生物膜滤池不一样。 在流动部和生物膜过滤部分别填装有立方形或圆筒形的聚氨基甲酸乙脂或聚乙烯的填料，其尺寸为数立方厘米，其比表面积为每立方米300到500平方米。